Atlas cedar decline
Cedrus atlantica decline in Belezma, Algeria
La pourriture du collet
Agent causal = Phytophthora cinnamomi Rands
Cette maladie, devenant très menaçante est connue sur plus de 1000 espèces ligneuses, signalée essentiellement sur les arbres fruitiers et actuellement sur des essences forestières résineuses ou feuillues, arbustes et arbrisseaux d’ornement.
Classification
Règne : Chromista (Straminipila)
Phylum : Oomycota (Oomycètes)
Ordre : Pythiales
Famille : Pythiaceae
Les Chromistes représentent un groupe relativement indépendant, le mot Chromista = coloré. La majorité des membres sont photosynthétiques, cependant, malgré leurs capacités autotrophiques, ils sont divergents des plantes supérieurs (Règne : Planta) car ils exhibent des différences plus ou moins marquantes.
Phylogénie des Chromistes, Source: Tree of Life Project
Mais la caractéristique principale de ce groupe, est le fait que tout les membres connaissent un stade unicellulaire biflagellé mobile au moins durant une partie (formes multicellulaires) ou toute la période du cycle biologique (formes unicellulaires). L’une des flagelles est garnie de cilles appelés « mastigonèmes ».
Le règne des Chromistes englobe environ 13 300 espèces réparties sur 11 divisions ou phylums, membres fongiques sont rangés au sein des phylums Hyphochytridiomycota, Labyrinthulomycota et Oomycota, ce dernier est le seul à avoir des taxons phytopathogènes.
Symptômes
Sur Pinacées, les manifestations pathologiques s’illustrent principalement par un feuillage (aiguilles) clairsemé, éparpillé.P. cinnamomi induit une pourriture suivie de la nécrose des racines fonctionnelles, conduisant à l’apparitiond’un « dieback» et la mort de l’arbre infecté. D’autres symptômes peuvent être visualisés, entre autres, des flétrissements et des chancres (avec souvent une mort soudaine), réduction de la production en biomasse, gommose intense, pourritures du bois interne. Les aiguilles deviennent plus petites qu’à la normale, se jaunissent progressivement.
Nécrose interne du collet (forestryimages.org)
Pratiquement, l’arbre meurt dans 3 à 10 ans, selon la charge de l’inoculum initial, l’aptitude de l’hôte à l’égard de l’infection, la virulence du pathogène, mais également – et surtout – les conditions climatiques régnantes ; en effet, Phytophthora cinnamomi compte parmi les mycotaxons pathogènes qui peuvent prendre de l’ampleur sur le plant de sévérité et de virulence après des années successives d’extrêmes climatiques, marquées notamment par le déséquilibre hydrique déficitaire (suite à la sécheresse et le dessèchement conséquent du sol). Dans ce cas ,ne pas confondre l’état de l’hôte car se dernier peut demeurer performant sur le plan physiologique, la question concerne surtout le pathogène.
Les préjudices peuvent atteindre la fertilité de l’arbre : et chatons réduits, stériles, avortement, embryons mal formés, chute prématurée des fruits.
Le changement, ou de préférence, la déviation du comportement trophique de P. cinnamomi vers la pathogenèse se marque notamment par la résistance aux barrières défensives de l’arbre ; la production de toxines qui induisent la nécrose des tissus rhizodermiques et sous-corticaux, ainsi que l’élargissement de la gamme d’hôtes.
P. cinnamomi est inféodé au système radiculaire, sur cèdre de l’Atlas, le pathogène a été détecté au Sud-est des USA, au niveau des plantations. Aucune investigation n’a été réalisé sur les peuplements naturels.
Cycle biologique généralisé de P. cinnamomi (Die-Back Project, Australia)
La présence du champignon à l’état libre dans le sol est peu fréquente. En général, la répartition est relativement liée à la profondeur, les Oospores sont localisées surtout dans les couches supérieures (5-20 cm). P. cinnamomipréfère les sols argileux et peu drainés, sur substrat parental tendre. Il attaque de préférence la partie radiculaire la plus active (fonctionnelle).
Mycélium de P. cinnamomi (INRA, France)
Sporongium du champignon (D. Davison)
Actuellement, on constate que les rapports d’alerte sur la présence de ce champignon deviennent de plus en plus nombreux et inquiétants. Il parait ainsi que le pourtour méditerranéen sera beaucoup plus concerné dans lesannées prochaines.
Sujets mort, sévèrement attaqués par P. cinnamomi (forestryimages.org)